Çoğul dirençli acinetobacter baumannii izolatlarında kolistin, polimiksin B ve tigesiklin direncinin saptanmasında disk difüzyon, E-test ve buyyon mikrodilüsyon yöntemlerinin karşılaştırılması

Acinetobacter baumannii'nin antimikrobiyal direnç oranlarının artması, bu etken ile oluşan enfeksiyonların tedavisinde polimiksinler gibi eski antibiyotiklerin yeniden gündeme gelmesini ve tigesiklin gibi yeni antibiyotiklerin geliştirilmesini zorunlu kılmıştır. Bu çalışmada, Eylül 2006-Nisan 2...

Full description

Saved in:
Bibliographic Details
Published in:Mikrobiyoloji bülteni Vol. 44; no. 2; pp. 203 - 210
Main Authors: AKIN, F. Ebru, Özgür, BAYRAM, Ayşen, BALCI, İclal
Format: Journal Article
Language:Turkish
Published: Mikrobiyoloji Derneği 2010
Online Access:Get full text
Tags: Add Tag
No Tags, Be the first to tag this record!
Abstract Acinetobacter baumannii'nin antimikrobiyal direnç oranlarının artması, bu etken ile oluşan enfeksiyonların tedavisinde polimiksinler gibi eski antibiyotiklerin yeniden gündeme gelmesini ve tigesiklin gibi yeni antibiyotiklerin geliştirilmesini zorunlu kılmıştır. Bu çalışmada, Eylül 2006-Nisan 2008 tarihleri arasında Gaziantep Üniversitesi, Şahinbey Araştırma ve Uygulama Hastanesi, Mikrobiyoloji Laboratuvarında izole edilen ve çoğul antibiyotik direnci gösteren A.baumannii suşlarının kolistin, polimiksin B ve tigesikline karşı duyarlılıklarının üç farklı yöntemle araştırılması amaçlanmıştır. Çalışmaya çeşitli klinik örneklerden (trakeal aspirat, kan, balgam, cerrahi yara, kateter, plevral sıvı, idrar, diğer) izole edilen 200 adet A.baumannii suşu alınmış; bakterilerin tanımlanması konvansiyonel mikrobiyolojik yöntemler ve tam otomatik tanımlama sistemi (Vitek 2, bioMerieux, Fransa) ile yapılmıştır. İzolatlarının antimikrobiyal duyarlılıkları disk difüzyon yöntemi ile belirlenmiş ve saptanan çok ilaca dirençli 95 A.baumannii suşunun kolistin, polimiksin B ve tigesikline karşı duyarlılıkları disk difüzyon, E-test ve buyyon mikrodilüsyon yöntemleriyle test edilmiştir. Bu suşların tamamı (%100) her üç yöntemle de kolistine duyarlı bulunurken, 92 (%96.8)'si disk difüzyon ve buyyon mikrodilüsyon yöntemleriyle, 90 (%94.7)'ı ise E-test yöntemi ile polimiksin B'ye duyarlı bulunmuştur. A.baumannii suşlarının tigesiklin duyarlılığı ise disk difüzyon yöntemi ile %87.4 (n= 83), E-test yöntemi ile %82.1 (n= 78) ve buyyon mikrodilüsyon yöntemi ile %94.7 (n= 90) olarak belirlenmiştir. Suşların polimiksin B'ye karşı her üç yöntem ile elde edilen direnç oranları arasında istatistiksel olarak anlamlı bir fark saptanmamış (p> 0.05); tigesikline karşı duyarlılığın tespitinde ise, disk difüzyon ile buyyon mikrodilüsyon yöntemleri arasındaki fark anlamlı bulunmazken (p> 0.05), buyyon mikrodilüsyon ile E-test yöntemleri arasındaki farkın istatistiksel olarak anlamlı olduğu görülmüştür (p=0.000). Buna göre, izolatların polimiksin grubu antibiyotiklere karşı duyarlılık sonuçlarının her üç yöntemle de birbirleriyle uyumlu olduğu, tigesiklinin duyarlılığının ise E-test ile diğer yöntemlere göre daha düşük oranda tespit edildiği düşünülmüştür. Sonuç olarak kolistin, polimiksin B ve tigesiklinin, hastanemizde izole edilen klinik A.baumannii suşlarına karşı antimikrobiyal etkinliklerinin yüksek olduğu ve çoğul dirençli A.baumannii suşlarının tigesikline duyarlılığının araştırılmasında, disk difüzyon veya buyyon mikrodilüsyon yöntemlerinin kullanılmasının daha uygun olacağı kanısına varılmıştır. The increased rate of antimicrobial resistance in Acinetobacter baumannii made it necessary to reconsider old antibiotics such as polymyxins and develop new drugs such as tigecycline. The aim of this study was to investigate the susceptibility rates of multi-drug resistant A.baumannii clinical isolates to colistin, polymyxin B, and tigecycline by three different methods in microbiology laboratory of Gaziantep University Research Hospital, between September 2006 and April 2008. A total of 200 A.baumannii strains isolated from various clinical samples (tracheal aspirate, blood, sputum, surgical wound, catheter, pleural fluid, urine, and others) were included to the study. Identification of bacteria was performed by conventional microbiological methods and by an automatized identification system (Vitek 2, bioMerieux, France). Antimicrobial susceptibility pattern of A.baumannii isolates was determined by disc diffusion method and 95 multiple resistant A.baumannii isolates were identified. Susceptibilities of these multiple resistant bacteria to colistin, polymyxin B, and tigecycline were tested with disc diffusion, E-test, and broth microdilution methods. All of the isolates (100%) were sensitive to colistin with all three methods. Ninety-two (96.8%) of them were sensitive to polymyxin B with both disc diffusion and broth microdilution methods, and 90 (94.7%) of them were sensitive to polymyxin B with E-test. Eighty-three (87.4%) of them were sensitive to tigecycline by disc diffusion method, 78 (82.1%) by E-test, and 90 (94.7%) by broth microdilution method. No statistically significant difference was detected for the three methods in terms of susceptibility testing for polymyxin B (p> 0.05). However, while no significant difference was detected for tigecycline susceptibility testing by disk diffusion and broth microdilution (p> 0.05), statistically significant difference was determined for broth microdilution and E-test methods (p= 0.000). In conclusion, comparison of disc diffusion, E-test, and broth microdilution methods yielded that all three methods were concordant to each other in terms of susceptibility testing of polymyxins. Susceptibility rate to tigecycline was found lower by E-test method than that obtained by other methods. These results emphasized that antimicrobial activities of colistin, polymyxin B and tigecycline against A.baumannii isolates obtained in our hospital were high, however, for tigecycline susceptibility testing against A.baumannii, disk diffusion or broth microdilution methods would rather be preferred.
AbstractList Acinetobacter baumannii'nin antimikrobiyal direnç oranlarının artması, bu etken ile oluşan enfeksiyonların tedavisinde polimiksinler gibi eski antibiyotiklerin yeniden gündeme gelmesini ve tigesiklin gibi yeni antibiyotiklerin geliştirilmesini zorunlu kılmıştır. Bu çalışmada, Eylül 2006-Nisan 2008 tarihleri arasında Gaziantep Üniversitesi, Şahinbey Araştırma ve Uygulama Hastanesi, Mikrobiyoloji Laboratuvarında izole edilen ve çoğul antibiyotik direnci gösteren A.baumannii suşlarının kolistin, polimiksin B ve tigesikline karşı duyarlılıklarının üç farklı yöntemle araştırılması amaçlanmıştır. Çalışmaya çeşitli klinik örneklerden (trakeal aspirat, kan, balgam, cerrahi yara, kateter, plevral sıvı, idrar, diğer) izole edilen 200 adet A.baumannii suşu alınmış; bakterilerin tanımlanması konvansiyonel mikrobiyolojik yöntemler ve tam otomatik tanımlama sistemi (Vitek 2, bioMerieux, Fransa) ile yapılmıştır. İzolatlarının antimikrobiyal duyarlılıkları disk difüzyon yöntemi ile belirlenmiş ve saptanan çok ilaca dirençli 95 A.baumannii suşunun kolistin, polimiksin B ve tigesikline karşı duyarlılıkları disk difüzyon, E-test ve buyyon mikrodilüsyon yöntemleriyle test edilmiştir. Bu suşların tamamı (%100) her üç yöntemle de kolistine duyarlı bulunurken, 92 (%96.8)'si disk difüzyon ve buyyon mikrodilüsyon yöntemleriyle, 90 (%94.7)'ı ise E-test yöntemi ile polimiksin B'ye duyarlı bulunmuştur. A.baumannii suşlarının tigesiklin duyarlılığı ise disk difüzyon yöntemi ile %87.4 (n= 83), E-test yöntemi ile %82.1 (n= 78) ve buyyon mikrodilüsyon yöntemi ile %94.7 (n= 90) olarak belirlenmiştir. Suşların polimiksin B'ye karşı her üç yöntem ile elde edilen direnç oranları arasında istatistiksel olarak anlamlı bir fark saptanmamış (p> 0.05); tigesikline karşı duyarlılığın tespitinde ise, disk difüzyon ile buyyon mikrodilüsyon yöntemleri arasındaki fark anlamlı bulunmazken (p> 0.05), buyyon mikrodilüsyon ile E-test yöntemleri arasındaki farkın istatistiksel olarak anlamlı olduğu görülmüştür (p=0.000). Buna göre, izolatların polimiksin grubu antibiyotiklere karşı duyarlılık sonuçlarının her üç yöntemle de birbirleriyle uyumlu olduğu, tigesiklinin duyarlılığının ise E-test ile diğer yöntemlere göre daha düşük oranda tespit edildiği düşünülmüştür. Sonuç olarak kolistin, polimiksin B ve tigesiklinin, hastanemizde izole edilen klinik A.baumannii suşlarına karşı antimikrobiyal etkinliklerinin yüksek olduğu ve çoğul dirençli A.baumannii suşlarının tigesikline duyarlılığının araştırılmasında, disk difüzyon veya buyyon mikrodilüsyon yöntemlerinin kullanılmasının daha uygun olacağı kanısına varılmıştır. The increased rate of antimicrobial resistance in Acinetobacter baumannii made it necessary to reconsider old antibiotics such as polymyxins and develop new drugs such as tigecycline. The aim of this study was to investigate the susceptibility rates of multi-drug resistant A.baumannii clinical isolates to colistin, polymyxin B, and tigecycline by three different methods in microbiology laboratory of Gaziantep University Research Hospital, between September 2006 and April 2008. A total of 200 A.baumannii strains isolated from various clinical samples (tracheal aspirate, blood, sputum, surgical wound, catheter, pleural fluid, urine, and others) were included to the study. Identification of bacteria was performed by conventional microbiological methods and by an automatized identification system (Vitek 2, bioMerieux, France). Antimicrobial susceptibility pattern of A.baumannii isolates was determined by disc diffusion method and 95 multiple resistant A.baumannii isolates were identified. Susceptibilities of these multiple resistant bacteria to colistin, polymyxin B, and tigecycline were tested with disc diffusion, E-test, and broth microdilution methods. All of the isolates (100%) were sensitive to colistin with all three methods. Ninety-two (96.8%) of them were sensitive to polymyxin B with both disc diffusion and broth microdilution methods, and 90 (94.7%) of them were sensitive to polymyxin B with E-test. Eighty-three (87.4%) of them were sensitive to tigecycline by disc diffusion method, 78 (82.1%) by E-test, and 90 (94.7%) by broth microdilution method. No statistically significant difference was detected for the three methods in terms of susceptibility testing for polymyxin B (p> 0.05). However, while no significant difference was detected for tigecycline susceptibility testing by disk diffusion and broth microdilution (p> 0.05), statistically significant difference was determined for broth microdilution and E-test methods (p= 0.000). In conclusion, comparison of disc diffusion, E-test, and broth microdilution methods yielded that all three methods were concordant to each other in terms of susceptibility testing of polymyxins. Susceptibility rate to tigecycline was found lower by E-test method than that obtained by other methods. These results emphasized that antimicrobial activities of colistin, polymyxin B and tigecycline against A.baumannii isolates obtained in our hospital were high, however, for tigecycline susceptibility testing against A.baumannii, disk diffusion or broth microdilution methods would rather be preferred.
Author AKIN, F. Ebru, Özgür
BAYRAM, Ayşen
BALCI, İclal
Author_xml – fullname: AKIN, F. Ebru, Özgür
– fullname: BAYRAM, Ayşen
– fullname: BALCI, İclal
BookMark eNqFjjFOw0AQRbcIEgFyBKQ9AJbsJATcgoI4AH00jjdo2NlZa3eN5FyAY7ikdkOVzk7LmdgYeqaY-X9G_2kuxIQtq4mYpou7ZZKn-epczLx_S2Mt8-w-T6fiu_-wQ1uTLNEp7j8JJWyRVbAFbINysoDaADOixL0lCARu6LgEqS2hD8g3sorKoPbI8kG-KxnwVXnUFP1IjbwoPVQB2ID_jZfodWy7_rBvbISsk6B8OMWLuokbGYnOlkj9wZ9s039xUIaUG2ka3LEdOoJjG4YuvkQj-Uqc7YC8mv3NS3H9tH55fE5qAl2g2VQODbhmk83n2e1q8d_9Bx0XeBI
ContentType Journal Article
DatabaseTitleList
DeliveryMethod fulltext_linktorsrc
Discipline Biology
DocumentTitleAlternate Comparison of disc diffusion, E-test, and broth microdilution methods for the determination of resistance to colistin, polymyxin B, and tigecycline in multi-resistant acinetobacter baumannii isolates
EndPage 210
ExternalDocumentID 122156
GroupedDBID 123
53G
A8Z
AENEX
ALMA_UNASSIGNED_HOLDINGS
EBD
F5P
GJB
OBODZ
OK1
SV3
SW3
ID FETCH-ulakbim_primary_1221563
ISSN 0374-9096
IngestDate Tue Jan 05 18:08:01 EST 2021
IsOpenAccess true
IsPeerReviewed true
IsScholarly true
Issue 2
Language Turkish
LinkModel OpenURL
MergedId FETCHMERGED-ulakbim_primary_1221563
Notes TTIP
ParticipantIDs ulakbim_primary_122156
PublicationCentury 2000
PublicationDate 2010
PublicationDateYYYYMMDD 2010-01-01
PublicationDate_xml – year: 2010
  text: 2010
PublicationDecade 2010
PublicationTitle Mikrobiyoloji bülteni
PublicationYear 2010
Publisher Mikrobiyoloji Derneği
Publisher_xml – name: Mikrobiyoloji Derneği
References 8. Falagas ME, Kasiakou SK. Colistin: The revival of polymyxins for the management of multidrug-resistant gram negative bacterial infections. Clin Infect Dis 2005; 40: 1333-41. 9. Ulusoy S. Tigesiklin. ANKEM 2006; 20: 117-9.
2, disk diffusion, E test, broth microdilution, and agar dilution susceptibility testing methods for colistin in clinical isolates, including heteroresistant Enterobacter cloacae and Acinetobacter baumannii strains. Antimicrob Agents Chemother 2007; 51: 3726-30.
11. Hawley J, Murray CK, Griffith ME, et al. Susceptibility of Acinetobacter strains isolated from deployed U.S. military personnel. Antimicrob Agents Chemother 2007; 51: 376-8.
14. Lolans K, Rice TW, Munoz-Price SL, Quinn JP. Multicity outbreak of carbapenem-resistant Acinetobacter baumannii isolates producing the carbapenemase OXA-40. Antimicrob Agents Chemother 2006; 50: 2941-5.
12. Arroyo LA, Garcia-Curiel A, Pachon-Ibanez MA, et al. Reliability of the E-test method for detection of colistin resistance in clinical isolates of Acinetobacter baumannii. J Clin Microbiol 2005; 43: 903-5.
5. Falagas ME, Koletsi PK, Bliziotis IA. The diversity of definitions of multidrug-resistant (MDR) and pandrugresistant (PDR) Acinetobacter baumannii and Pseudomonas aeruginosa. J Med Microbiol 2006; 55: 1619-29.
10. Lo-Ten-Foe JR, de Smet AM, Diederen BM, Kluytmans JA, Keulen PH. Comparative evaluation of the VITEK
17. Navon-Venezia S, Leavitt A, Carmeli Y. High tigecycline resistance in multidrug-resistant Acinetobacter baumannii. J Antimicrob Chemother 2007; 59: 772-4.
1. Akalın H. Kolistin. ANKEM 2007; 21: 26-8.
4. Clinical and Laboratory Standards Institute. Performance standards for antimicrobial disk susceptibility tests. Approved Standard M2-A9. 2007, 9th ed. CLSI, Wayne, PA.
6. Bergogne-Berezin E, Towner KJ. Acinetobacter spp. as nosocomial pathogens: microbiological, clinical, and epidemiological features. Clin Microbiol Rev 1996; 9: 148-65.
16. Pachon-Ibanez ME, Jimenez-Mejias ME, Pichardo C, Llanos AC, Pachon J. Activity of tigecycline (GAR-936) against Acinetobacter baumannii strains, including those resistant to imipenem. Antimicrob Agents Chemother 2004; 48: 4479-81.
2. Li J, Nation RL, Milne RW, Turnidge JD, Coulthard K. Evaluation of colistin as an agent against multi-resistant Gram-negative bacteria. Int J Antimicrob Agents 2005; 25: 11-25.
19. Tiengrim S, Tribuddharat C, Thamlikitkul V. In vitro activity of tigecycline against clinical isolates of multidrug-resistant Acinetobacter baumannii in Siriraj Hospital, Thailand. J Med Assoc Thai 2006; 89: 102-5.
7. Towner K. The genus Acinetobacter. Prokaryotes 2006; 6: 746-58.
3. Çalık N, Akova M. Tigesiklin. ANKEM 2007; 21: 29-33.
15. Song JG, Kee SY, Hwang IS, et al. In vitro activities of carbapenem/sulbactam combination, colistin, colistin/rifampicin combination and tigecycline against carbapenem-resistant Acinetobacter baumannii. J Antimicrob Chemother 2007; 60: 317-22.
18. Akıncı E, Mumcuoğlu İ, Öngörü P, et al. In vitro activity of tigecycline against Acinetobacter baumannii strains isolated from nosocomial infections. Turk J Med Sci 2008; 38: 583-6.
13. Mezzatesta ML, Trovato G, Gona F. In vitro activity of tigecycline and comparators against carbapenemsusceptible and resistant Acinetobacter baumannii clinical isolates in Italy. Ann Clin Microbiol Antimicrob 2008; 7: 4-7.
References_xml
SSID ssj0000491890
Score 3.55318
Snippet Acinetobacter baumannii'nin antimikrobiyal direnç oranlarının artması, bu etken ile oluşan enfeksiyonların tedavisinde polimiksinler gibi eski antibiyotiklerin...
SourceID ulakbim
SourceType Open Access Repository
StartPage 203
Title Çoğul dirençli acinetobacter baumannii izolatlarında kolistin, polimiksin B ve tigesiklin direncinin saptanmasında disk difüzyon, E-test ve buyyon mikrodilüsyon yöntemlerinin karşılaştırılması
Volume 44
hasFullText 1
inHoldings 1
isFullTextHit
isPrint
link http://sdu.summon.serialssolutions.com/2.0.0/link/0/eLvHCXMwtV07b9swECaSAAW6FH0FfaXg0I1RIVvWa7Qcp0nbdGgztFOglwvGtBxYUgD5D_RneOzspVM2OWt_U-9IvQy0QDt0ISiaPJ51n8g7Pu4IeWXZ8cBF15eu5ZsaOpTTnP5kAKaKY0VBZIW6jfedTz7ZHz47R-PBeGe3jpnZlv1XSUMZyBpvzv6DtBuiUAB5kDmkIHVI_0ruuPPt2HNUEl2wLxnOWYncDrcFZz7uo-M3jD6aWeDjEn7COeNLMHEzsHKxndcDO51N5wK_fzkqYSiHGZ-mPGEeu45ZhttSHIO9K_ohhplgqX8FqubMT1siEZ5cj_gEGfBGy6KKHKKBgpshoSAvoIwBbRjIuVDVUiwqZN5C31kCrygC_SmyZ8LfUvSFr54y9VixLpr-u3r3GXYQ8AKG-kvOAtWPAHuBN4h_dypPPBy_ZuNgkWMWa7nW8quq3Zxi9oZfPg7P5KBaKA7a63Te8P3oVLUFFvRQVOKq1lWqs7XyVNUWR0cxLi1LmfHO2GzYA83VVTDeeiJRjiyrD6bfnRV0o6Ng9Ku-tt189_qgfKHreDDocXR-89Zr1grBius5armw7hfMtVz404DPOurQ-X1yr7Jj6FAB8AHZyRYPyR0V2bR4RH6W3-abVS6ohEf5XXC6BT3aQI820NusATG0ht0hbUFHPXod0xZ0tAUdbUCnmiPgIJmUNwi2Q6qghs0V1GgNtfIGYUaL8kcHYhQgdrvarIV_u8o2a2BJSMqPycHx-Hx0olVv4-JKOWm5UO_T2Cd7yTyJnxAa2HakT1zDCMGGiEzT9_UIbBXLikITintPyf7vaTz70w_PyV11lgQX5F6QvWyRxwdkN43yl1J-vwAp3qPp
link.rule.ids 315,782,786,4029
linkProvider Ulusal Akademik Ag ve Bilgi Merkezi (ULAKBIM)
openUrl ctx_ver=Z39.88-2004&ctx_enc=info%3Aofi%2Fenc%3AUTF-8&rfr_id=info%3Asid%2Fsummon.serialssolutions.com&rft_val_fmt=info%3Aofi%2Ffmt%3Akev%3Amtx%3Ajournal&rft.genre=article&rft.atitle=%C3%87o%C4%9Ful+diren%C3%A7li+acinetobacter+baumannii+izolatlar%C4%B1nda+kolistin%2C+polimiksin+B+ve+tigesiklin+direncinin+saptanmas%C4%B1nda+disk+dif%C3%BCzyon%2C+E-test+ve+buyyon+mikrodil%C3%BCsyon+y%C3%B6ntemlerinin+kar%C5%9F%C4%B1la%C5%9Ft%C4%B1r%C4%B1lmas%C4%B1&rft.jtitle=Mikrobiyoloji+b%C3%BClteni&rft.au=AKIN%2C+F.+Ebru%2C+%C3%96zg%C3%BCr&rft.au=BAYRAM%2C+Ay%C5%9Fen&rft.au=BALCI%2C+%C4%B0clal&rft.date=2010&rft.pub=Mikrobiyoloji+Derne%C4%9Fi&rft.issn=0374-9096&rft.volume=44&rft.issue=2&rft.spage=203&rft.epage=210&rft.externalDocID=122156
thumbnail_l http://covers-cdn.summon.serialssolutions.com/index.aspx?isbn=/lc.gif&issn=0374-9096&client=summon
thumbnail_m http://covers-cdn.summon.serialssolutions.com/index.aspx?isbn=/mc.gif&issn=0374-9096&client=summon
thumbnail_s http://covers-cdn.summon.serialssolutions.com/index.aspx?isbn=/sc.gif&issn=0374-9096&client=summon