VALIDACIÓN DE QTLS ASOCIADOS A MORFOLOGÍA DE FRUTO DETECTADOS POR ANÁLISIS DE GRUPOS DISCREPANTES EN UNA POBLACIÓN F2 DE TOMATE

• Published in: BAG. Journal of basic and applied genetics Vol. 35; p. 66
• Main Authors: Godoy, F N I, Vazquez, D V, Cambiaso, V, Da Costa, J H Pereira, Rodríguez, G R
• Format: Journal Article
• Language: Spanish
• Published: Buenos Aires Sociedad Argentina de Genetica 01-09-2024
• Subjects: Quantitative trait loci
• ISSN: 1666-0390; 1852-6233

En tomate (Solanum lycopersicum L.) los genes SUN, OVATE, SOV1 y FS8.1 controlan la forma del fruto en su plano longitudinal. Para dichos genes, los cultivares Río Grande y LYC1907 sólo difieren para FS8.1. En una población F2 derivada del cruzamiento de estos cultivares, la segregación de FS8.1 afectó la expresión del carácter índice de forma de fruto (IF=altura/ diámetro). Al comparar las secuencias de genoma completo de grupos de plantas contrastantes para el IF (metodología QTL-seq), se detectaron regiones genómicas asociadas al IF en los cromosomas (cr.) 2, 3, 8 y 9, para las cuales se desarrollaron marcadores moleculares (MM) de tipo inserción/deleción. En este trabajo se buscó validar las regiones genómicas asociadas al IF detectadas empleando los MM diseñados. Para ello, la población F2 de 185 plantas fue caracterizada con tres MM del cr.2, uno del cr.3, tres del cr.8 y uno del cr.9, utilizando un protocolo de amplificación por PCR con posterior electroforesis en gel de agarosa al 3% p/v. Se determinó la asociación fenotípico-molecular por ANOVA a un factor, fijando el efecto de FS8.1. Se encontró asociación significativa (p<0,05) entre el IF y los MM en los cr.3 y cr.9, independientes del genotipo de FS8.1. Para el cr.2, esta asociación fue significativa sólo cuando FS8.1 portaba los alelos de LYC1907. En estos cromosomas, los alelos de Río Grande generaron tanto un aumento (cr.3) como una reducción (cr.2 y 9) de la media del IF. En conclusión, se validó que las regiones genómicas detectadas en los cromosomas 2, 3 y 9 por QTL-seq controlan la expresión del carácter IF.