Aspects épidémiologiques et virologiques des diarrhées dues aux Rotavirus à Abidjan, Côte d'Ivoire (1997-2000)

• Published in: Bulletin de la Société de pathologie exotique Vol. 100; no. 4; pp. 246 - 249
• Main Authors: AKOUA-KOFFI, C, AKRAN, V, PEENZE, I, ADJOGOUA, V, DE BEER, M. C, STEELE, A. D, DOSSO, M, EHOUMAN, A
• Format: Journal Article
• Language: French
• Published: Paris Société de pathologie exotique 01-10-2007; Masson
• Subjects: Age Factors; Antigens, Viral; Bacteriology; Capsid Proteins; Child, Preschool; Cote d'Ivoire; Diarrhea, Infantile; Electrophoresis, Polyacrylamide Gel; Epidemiologic Studies; Feces; Gastroenteritis; Generalites; Genotype; Humans; Infant; Life Sciences; Microbiology and Parasitology; Prevalence; RNA-Binding Proteins; Rotavirus; Rotavirus Infections; Sciences biologiques et medicales; Sciences medicales; Viral Nonstructural Proteins; Côte d'Ivoire; Afrique; Médecine tropicale; Appareil digestif pathologie; Rotavirus; génotype VP4; électrophorétype; Diarrhée; sous-groupe VP6; Intestin pathologie; Côte d'Ivoire; Reoviridae; Virus; Infection; Homme; Santé publique; Génotype; Epidémiologie; Abidjan; Afrique intertropicale; Côte d'Ivoire; VP6 sub-group; VP4 genotype; diarrhoea; electrophoretype; Sub Saharan Africa
• ISSN: 0037-9085; 1961-9049

Viruses, mainly rotaviruses are aetiological agents in more than 80% of the cases of acute diarrhoea in children. In order to determine the epidemiological characteristics and genotypes of human rotaviruses involved in gastroenteritis in diarrheic children aged from 0 to 5 years old in Abidjan, 642 specimens of stools were collected between 1997 and 2000 in the urban health centres and University Teaching Hospitals in Abidjan. The antigenic detection of rotaviruses carried out by ELISA test was followed by the antigenic (VP6 sub-groups) and molecular characterization: polyacrylamide gel electrophoresis and genetic typing. The general prevalence of Rotavirus diarrhoea was 27.9%. Among the children who were found positive, those whose age ranged from 0 to 11 months old accounted for 45.8% against 41.3% and 12.9% for those whose age ranged from 1 to 2 and 3 to 5 years old respectively proving thus the precocity of rotavirus infection. From an electrophoretypical and antigenic point of view 74.5% of 141 extracts of RNA had a "long" profile and belonged to the VP6 II sub-group against 24.8% of "short" profile belonging to sub-group I. The electrophoretypes with short profile were identified in majority in infants whose age ranged from 0 to 2 years old. Out of the P genotypes identified, the P [8] genotype (59.6%) was predominant followed by the P [6] genotype (26.2%), P [4] (2.8%) and one mosaic genotype P[6,8] which represented 11.4%. These results will need to be completed by the determination of VP7 genotypes in order to provide interesting information on rotaviruses before the introduction of anti-Rotavirus vaccines in the country.
Dans le but de déterminer les caractéristiques épidémiologiques et les génotypes des Rotavirus humains impliqués dans les gastro-entérites chez des enfants diarrhéiques de 0 à 5 ans à Abidjan, 642 échantillons de selles ont été recueillis entre 1997 et 2000, dans les formations sanitaires urbaines et les centres hospitaliers universitaires d'Abidjan. La détection antigénique des Rotavirus réalisée par test ELISA a été suivie par la caractérisation antigénique (sous-groupes VP6) et moléculaire : électrophorèse en gel de polyacrylamide et typage génique VP4. La prévalence globale de la diarrhée due aux Rotavirus était de 27,9%. Parmi les enfants trouvés positifs, ceux de la tranche d'âge 0-11 mois représentaient 45,8%, contre 41,3% et 12,9% pour ceux des tranches d'âge 1-2 ans et 3-5 ans respectivement, démontrant ainsi la précocité de l'infection par Rotavirus. Du point de vue électrophorétypique et antigénique, 74,5 % de 141 ARN extraits avaient un profil «long» et étaient de sous-groupe VP6 II, contre 24,8% de profil court et du sous-groupe I. Les électrophorétypes de profil «court» ont été identifiés chez les enfants de 0 à 2 ans majoritairement. Des génotypes P identifiés, le génotype P[8] (59,6%) était majoritaire, suivi du génotype P[6] (26,2%) et P[4] (2,8%) et un génotype en mosaïque P[6,8] représentant 11,4%. Ces résultats devront être complétés par la détermination des génotypes VP7 afin de fournir des informations d'intérêt sur les Rotavirus circulants avant l'introduction des vaccins anti-Rotavirus dans le pays.