Genome size variation among recent human isolates of Salmonella typhi

• Published in: Research in microbiology Vol. 148; no. 3; pp. 229 - 235
• Main Authors: Thong, K.L., Puthucheary, S.D., Pang, T.
• Format: Journal Article
• Language: English
• Published: Paris Elsevier SAS 01-03-1997; Elsevier
• Subjects: Bacteriology; Base Sequence; Biological and medical sciences; Chromosomes, Bacterial - genetics; Electrophoresis, Gel, Pulsed-Field; Feces - microbiology; Fundamental and applied biological sciences. Psychology; Genetic Variation; Genetics; Genome; Genome, Bacterial; Génome; Humans; Microbiology; PFGE; Plasticity; Plasticitél; Restriction Mapping; Salmonella typhi; Salmonella typhi - genetics; Salmonella typhi - isolation & purification; Size variation; Tropical medicine; Typhoid Fever - blood; Typhoid Fever - microbiology; Variation de la taille; Virulence; Size variation; PFGE; Plasticitél; Génome; Virulence; Plasticity; Salmonella typhi; Variation de la taille; Genome; Human; Pulsed field electrophoresis; DNA; Bacteria; Genetic diversity; Molecular size; Clinical isolate; Enterobacteriaceae; Polymorphism
• ISSN: 0923-2508; 1769-7123
• DOI: 10.1016/S0923-2508(97)85243-6

We performed genome size estimation of 17 recent human isolates of
Salmonella typhi from geographically diverse regions using pulsed-field gel electrophoresis (PFGE) after digestion of chromosomal DNA with restriction endonucleases
XbaI (5′-TCTAGA-3′),
AvrII (5′-CCTAGG-3′) and
SpeI (5′-ACTAGT-3′), and summation of the sizes of restriction fragments obtained. All 17 isolates had circular chromosomes, and genome sizes differed by as much as 959 kb, ranging from 3,964 to 4,923 kb (mean genome size = 4,528 kb). The data obtained confirm the usefulness of PFGE in studies of bacterial genome size and are in agreement with recent results indicating considerable genetic diversity and genomic plasticity of
S. typhi. The variation in genome sizes noted may be relevant to the observed biological properties of this important human pathogen, including its virulence.
La taille génomique de 17 souches humaines de
Salmonella typhi récemment isolées dans diverses régions a été évaluée au moyen de l'électrophorèse en gel en champ pulsé (ou PFGE) après digestion de l'ADN chromosomique par les endonucléases de restriction
XbaI (5′-TCTAGA-3′),
AvrII (5′-CCTAGG-3′) et
SpeI (5′ ACTAGT-3′) et sommation des tailles des fragments obtenus. Les 17 souches ont des chromosomes circulaires, et les tailles des génomes diffèrent sensiblement (entre 3.964 et 4.923 kb, la taille moyenne étant de 4.528 kb et la plus grande différence, de 959 kb). La PFGE s'avère utile dans l'étude de la taille génomique et elle confirme la diversité génétique et la plasticité génomique de
S. typhi récemment observées. La variabilité de la taille génomique peut être en rapport avec les propriétés biologiques et notamment la virulence de cette bactérie importante en pathologie humaine.