Development of a Geographic Filter for PubMed to Identify Studies Performed in Spain

• Published in: Revista española de cardiologia Vol. 59; no. 12; pp. 1244 - 1251
• Main Authors: Valderas, José M., Mendivil, Joan, Parada, Antoni, Losada-Yáñez, Marina, Alonso, Jordi
• Format: Journal Article
• Language: English; Spanish
• Published: Spain Elsevier Espana 01-12-2006
• Subjects: Almacenamiento de información/están-dares; Bases de datos; Bibliografía/estándares; Bibliographic standards; Bibliometrics; Bibliometría; España; Evidence-Based Medicine; Filiación institucional; Information retrieval standards; Information Storage and Retrieval - methods; Information Storage and Retrieval - statistics & numerical data; Information storage standards; Information systems; Medicina basada en la evidencia; Organizational affiliation; Publicación/estándares; Publication standards; PubMed - statistics & numerical data; Recuperación de información/estándares; Sensitivity and Specificity; Sistemas de información; Spain; Spain; Bases de datos; Information retrieval standards; Bibliografía/estándares; Medicina basada en la evidencia; España; MeSH; Bibliometría; Recuperación de información/estándares; Evidence-based medicine; Spain; Information systems; Sistemas de información; Publicación/estándares; Databases; Filiación institucional; Information storage standards; Bibliometrics; Organizational affiliation; Bibliographic standards; Almacenamiento de información/están-dares; Publication standards
• ISSN: 1885-5857; 1885-5857; 1579-2242
• DOI: 10.1016/S1885-5857(07)60080-2

The increasing size of the PubMed (Medline) database has made it necessary to develop specific tools for information retrieval (i.e., filters). The current configuration of the Limits option in PubMed does not enable searches to be limited according to geographic criteria. Our objectives, therefore, were a) to develop a geographic filter for the retrieval from PubMed of studies performed in the Spanish population, and b) to assess its performance.
A second-generation filter was constructed by reviewing previous strategies. It involved the selection of three types of record that included: a) the term Spain in different languages; b) Spanish place names (i.e., mainly those of autonomous regions and provinces), and c) acronyms for health services in autonomous regions. The performance of the filter (i.e., its sensitivity and specificity) was assessed in a convenience sample (i.e., clinical trials indexed in PubMed under the MeSH term Myocardial Infarction) by comparison with the results of a manual search (the gold standard). In addition, the filter's performance was also evaluated by comparing it with a simple search for the term Spain[ad].
Use of the filter retrieved 74 (98.7%) of the relevant references. The sensitivity (88.1%) was higher than that of the simple search strategy (45.8%), and excellent specificity (100%) was achieved in both cases.
An efficient geographic filter has been developed for identifying studies in PubMed that involve the Spanish population.
El volumen de PubMed (Medline) hace necesarias herramientas específicas para la recuperación de información (filtros). La actual configuración de la opción «Limits» en PubMed no permite restringir las búsquedas según criterios geográficos. Por ello, se plantearon como objetivos: a) la construcción de un filtro geográfico para la recuperación en PubMed de estudios realizados en la población española, y b)la evaluación de su rendimiento.
Se ha construido un filtro de segunda generación, basado en la revisión de estrategias previas, para la selección de 3 bloques: a)el término «España» y sus variantes en diversos idiomas; b) otros topónimos correspondientes principalmente a comunidades autónomas y provincias, y c) acrónimos correspondientes a los servicios autonómicos de salud. Se evaluó el rendimiento del filtro (sensibilidad y especificidad) en una muestra de conveniencia (ensayos clínicos indizados en PubMed bajo el término MeSH «Myocardial Infarction»), para lo cual se tomó como patrón de referencia la revisión manual de las referencias. También se comparó el rendimiento del filtro con el de la búsqueda simple «spain[ad]».
El filtro ha recuperado 74 (98,7%) de las referencias pertinentes y ha demostrado una sensibilidad (88,1%) muy superior a la de la búsqueda simple (45,8%), alcanzándose una especificidad excelente en uno y otro caso (100%).
Se dispone de un filtro eficiente para la identificación de estudios realizados en población española en PubMed.