A novel report on killer yeast strains identification methods

• Published in: Basrah journal of agricultural sciences Vol. 33; no. 1; pp. 39 - 49
• Main Authors: Abu Mijdad, Najwa Muhammad Jamil Ali, al-Badran, Adnan Isa, al-Sadun, Abd Allah Hammud
• Format: Journal Article
• Language: English
• Published: البصرة، العراق جامعة البصرة، كلية الزراعة 2020; University of Basrah
• Subjects: Diagnosis; Diazonium blue B; Killer yeasts; PCR; VITEK; التشخيص; الجوانب الجزيئية
• ISSN: 1814-5868; 2520-0860
• DOI: 10.37077/25200860.2020.32.1.04

This study was conducted to isolate and identify killer yeasts from soil samples that collected from different locations in Basrah and Dhi-Qar provinces. Seventy-five soil samples were collected from different areas, including sandy, arable, surface sediment and uncultivated soil, using dilution methods to cultivate a serial dilution of each soil sample. The results showed that a 112 isolates were identified biochemically using VITEK system and molecularly using internal transcribed spacer (ITS1- 5. 8S-ITS2) marker. The molecular identification provided fast and precise identification results for the 112 isolates, whereas the VITEK test resulted low identification efficiency (8. 2% were accurate and 91. 8 % were not). The Diazonium blue B salts produced a good colour reaction in distinguishing between ascomycetes and basidiomycetes. The PCR was more accurate in identification of killer yeasts compared to the VITEK system
اجريت هذه الدراسة لعزل وتحديد الخمائر القاتلة من عينات التربة التي جمعت من مواقع مختلفة في محافظتي البصرةوذي قار. ت م جمع خمسة وسبعين عينة من التربة من مناطق مختلفة، بم ا ف ي ذلك الترب الرملية والزراعية والترب الغير مزروعة، وذلك باستخدام طرق التخفيف لزراعة كل عين ة من التربة. أوضحت النتائج أنه تم تحدي د 112 عزلة بطرائق كيموحيوية باستخدامنظام VITEK وجزيئيًا باستخداممنطقة ال (ITS1- 5. 8S-ITS2). اظهرالتشخيص الجزيئي نتائج تحدي د سريعة ودقيقة للعزلات112، في حين أدى اختبار VITEK إلى كفاءة تحدي د منخفضة ) 8. 2 ٪ كانت دقيقة و 91. 8 ٪ لم تكن كذلك(. اظهرت نتائج اختبارأملاح ديازونيوم الزرقاء B تفاعلًا جيدًا للألوان في التمييز بين الفطريات الكيسية والبازيديةو كان تشخيص تفاعل البلمرة التسلسليأكثر دقة في تحدي د الخمائر القاتلة مقارنة بنظام. VITEK