Les approches de génomique intégrative identifient un réseau de gènes pour le développement de médicaments anti-épileptiques

• Published in: Morphologie Vol. 102; no. 338; p. 147
• Main Authors: Delahaye-Duriez, Andrée, Srivastava, Prashant, Shkura, Kirill, Langley, Sarah, Danis, Benedicte, Mazzuferi, Manuela, Foerch, Patrik, Gazina, Elena, Richards, Kay, Petrou, Steven, Kaminski, Rafal, Petretto, Enrico, Johnson, Michael
• Format: Journal Article
• Language: French
• Published: Elsevier Masson SAS 01-09-2018
• Subjects: Cerveau; Exome; Réseau de gènes et de protéines; Transcriptome; Épilepsie; Exome; Réseau de gènes et de protéines; Cerveau; Épilepsie; Transcriptome
• ISSN: 1286-0115
• DOI: 10.1016/j.morpho.2018.07.113

L’épilepsie est une maladie neurologique grave qui se caractérise par une récurrence non provoquée de crises convulsives. La biologie des systèmes et les analyses de réseaux de gènes constituent des approches puissantes pour étudier les voies moléculaires impliquées dans l’épilepsie. Elles ont aussi déjà permis de pointer de nouvelles cibles thérapeutiques.
Des données en accès libre issues de plusieurs types d’études ont été ré-analysées en utilisant des approches de génomique intégrative basées sur l’analyse des réseaux de gènes et de protéines. La nouvelle exploitation de ces données a permis l’identification du réseau M30. Le réseau M30 se compose de 320 gènes largement exprimés dans le cerveau humain qui codent principalement pour des protéines qui sont impliquées dans des processus synaptiques.
L’altération fonctionnelle de M30 par des variations génétiques rares ou communes, et la diminution de son expression semblent constituer un mécanisme convergent influençant la susceptibilité à l’épilepsie et aux crises d’épilepsie en général. En tirant profit des changements d’expression induits par des médicaments rapportés pour 1300 composés thérapeutiques, nous avons pu sélectionner les médicaments dont l’effet sur l’expression de M30 est d’inverser la diminution d’expression observée dans les cerveaux épileptiques. Les meilleurs résultats ont été obtenus pour l’acide valproïque (anti-épileptique connu), apportant une nouvelle preuve de concept au paradigme de réversion de la signature transcriptionnelle comme stratégie thérapeutique.
Au total, nos résultats suggèrent qu’en ciblant le réseau M30 on pourrait identifier de nouvelles molécules anti-épileptiques et développer de nouvelles stratégies thérapeutiques contre l’épilepsie [1].