غربالگری برخی ارقام تجاری زردآلوی ایران با استفاده از نشانگرهای ریزماهواره با هدف شناسایی همنامیها
در ایران، بسیاری از ارقام محلی زردآلو توسط باغداران و نهالکاران با هدف بهره‌برداری از ارقام جدید در میان استانها جابجا شده و متعاقباً در برخی موارد نام آنها در مقصد تغییر یافته است. بنابراین برای مدیریت بهینه ژرمپلاسم زردآلوی کشور و شناسایی ارقامی که از نظر ژنتیکی از یکدیگر متفاوت هستند، غربالگ...
Saved in:
| Published in: | Majallah-i ʻulūm-i bāghbānī Vol. 35; no. 4; pp. 493 - 505 |
|---|---|
| Main Authors: | , , , , |
| Format: | Journal Article |
| Language: | Persian |
| Published: |
Ferdowsi University of Mashhad
01-02-2022
|
| Subjects: | |
| Online Access: | Get full text |
| Tags: |
Add Tag
No Tags, Be the first to tag this record!
|
| Abstract | در ایران، بسیاری از ارقام محلی زردآلو توسط باغداران و نهالکاران با هدف بهره‌برداری از ارقام جدید در میان استانها جابجا شده و متعاقباً در برخی موارد نام آنها در مقصد تغییر یافته است. بنابراین برای مدیریت بهینه ژرمپلاسم زردآلوی کشور و شناسایی ارقامی که از نظر ژنتیکی از یکدیگر متفاوت هستند، غربالگری ژرمپلاسم زردآلو در ایران ضروری به نظر میرسد. بنابراین هدف از انجام این مطالعه، غربالگری تعدادی از ارقام تجاری زردآلوی ایران با استفاده از نشانگرهای ریزماهواره، جهت بررسی وضعیت نامهای اطلاق شده به ارقام، شناسایی همنامیها و درک بهتر از تفاوتهای ژنتیکی میان ارقام بود. در این مطالعه 29 رقم مختلف زردآلو با پنج تکرار از 14 نهالستان از شش استان کشور جمعآوری شدند. برای ارزیابی وضعیت حفظ اصالت ژنتیکی در نهالستانهای کشور، برخی از ارقام، دو بار از نهالستانهای مختلف جمعآوری شدند. همچنین DNA 10 رقم بومی زردآلو که قبلا ثبت و در فهرست ملی ارقام وارد شده بودند نیز به عنوان شاهد در مطالعه گنجانده شدند. علاوه بر آن زردآلوی رقم Orange Red (با نام محلی پرتقالی) به عنوان نمونه Outgroup در این بررسیها گنجانده شد. برای انجام آزمایشات، استخراج DNA به روش CTAB انجام و از 13 جفت آغازگر ریزماهواره که در مطالعات مختلف بیشترین میزان تنوع را آشکار کرده بودند، برای انجام واکنشهای زنجیرهای پلیمراز استفاده شد. سپس محصولات این واکنشها بر روی ژل پلیاکریلامید ده درصد الکتروفورز شد. نتایج نشان داد که شاخصهای تنوع ژنی نی و شانون به ترتیب 0/32 و 0/48 بودند. بیشترین فاصله ژنتیکی (0/74) میان ارقام عسگرآبادی و زودرس و همچنین ارقام محلی گوشتی زودرس و نصیری مشاهده شد. در این مطالعه، برخی از ارقام علیرغم داشتن اسامی متفاوت، دارای زمینه ژنتیکی مشابهی بودند. همچنین نتایج نشان داد که ارقام نصیری، طبرزه و شاهرودی که هر کدام از دو نهالستان از استانهای متفاوت جمعآوری شده بودند، علیرغم نام یکسان دارای زمینه ژنتیکی متفاوتی بودند. در نهایت میتوان گفت که یکی از چالشهای جدی در مدیریت ژرمپلاسم و نهالستانهای کشور، عدم وجود باغات مادری استاندارد از ارقام اصیل بومی زردآلو جهت تامین پیوندکهای سالم و اصیل برای نهالستانها میباشد. |
|---|---|
| AbstractList | در ایران، بسیاری از ارقام محلی زردآلو توسط باغداران و نهالکاران با هدف بهره‌برداری از ارقام جدید در میان استانها جابجا شده و متعاقباً در برخی موارد نام آنها در مقصد تغییر یافته است. بنابراین برای مدیریت بهینه ژرمپلاسم زردآلوی کشور و شناسایی ارقامی که از نظر ژنتیکی از یکدیگر متفاوت هستند، غربالگری ژرمپلاسم زردآلو در ایران ضروری به نظر میرسد. بنابراین هدف از انجام این مطالعه، غربالگری تعدادی از ارقام تجاری زردآلوی ایران با استفاده از نشانگرهای ریزماهواره، جهت بررسی وضعیت نامهای اطلاق شده به ارقام، شناسایی همنامیها و درک بهتر از تفاوتهای ژنتیکی میان ارقام بود. در این مطالعه 29 رقم مختلف زردآلو با پنج تکرار از 14 نهالستان از شش استان کشور جمعآوری شدند. برای ارزیابی وضعیت حفظ اصالت ژنتیکی در نهالستانهای کشور، برخی از ارقام، دو بار از نهالستانهای مختلف جمعآوری شدند. همچنین DNA 10 رقم بومی زردآلو که قبلا ثبت و در فهرست ملی ارقام وارد شده بودند نیز به عنوان شاهد در مطالعه گنجانده شدند. علاوه بر آن زردآلوی رقم Orange Red (با نام محلی پرتقالی) به عنوان نمونه Outgroup در این بررسیها گنجانده شد. برای انجام آزمایشات، استخراج DNA به روش CTAB انجام و از 13 جفت آغازگر ریزماهواره که در مطالعات مختلف بیشترین میزان تنوع را آشکار کرده بودند، برای انجام واکنشهای زنجیرهای پلیمراز استفاده شد. سپس محصولات این واکنشها بر روی ژل پلیاکریلامید ده درصد الکتروفورز شد. نتایج نشان داد که شاخصهای تنوع ژنی نی و شانون به ترتیب 0/32 و 0/48 بودند. بیشترین فاصله ژنتیکی (0/74) میان ارقام عسگرآبادی و زودرس و همچنین ارقام محلی گوشتی زودرس و نصیری مشاهده شد. در این مطالعه، برخی از ارقام علیرغم داشتن اسامی متفاوت، دارای زمینه ژنتیکی مشابهی بودند. همچنین نتایج نشان داد که ارقام نصیری، طبرزه و شاهرودی که هر کدام از دو نهالستان از استانهای متفاوت جمعآوری شده بودند، علیرغم نام یکسان دارای زمینه ژنتیکی متفاوتی بودند. در نهایت میتوان گفت که یکی از چالشهای جدی در مدیریت ژرمپلاسم و نهالستانهای کشور، عدم وجود باغات مادری استاندارد از ارقام اصیل بومی زردآلو جهت تامین پیوندکهای سالم و اصیل برای نهالستانها میباشد. |
| Author | میترا رحمتی عبدالرضا کاوند مرتضی همتی سید رضا کاظمی مهدی رضائی |
| Author_xml | – sequence: 1 fullname: مهدی رضائی organization: مؤسسه تحقیقات ثبت و گواهی بذر و نهال، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی (AREEO)، کرج، ایران – sequence: 2 fullname: میترا رحمتی organization: مؤسسه تحقیقات ثبت و گواهی بذر و نهال، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی (AREEO)، کرج، ایران – sequence: 3 fullname: عبدالرضا کاوند organization: مؤسسه تحقیقات ثبت و گواهی بذر و نهال، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی (AREEO)، کرج، ایران – sequence: 4 fullname: مرتضی همتی organization: مؤسسه تحقیقات ثبت و گواهی بذر و نهال، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی (AREEO)، کرج، ایران – sequence: 5 fullname: سید رضا کاظمی organization: مؤسسه تحقیقات ثبت و گواهی بذر و نهال، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی (AREEO)، کرج، ایران |
| BookMark | eNqtjT1Ow0AQhVcoSATIAeh8gZj1ev1XIxD09JbtOOAoxMimoSMojlP4FDRGUYTlkApxkBnScRJ2AkegmjdvvvfmkHUm6SRm7MTguhDcdk5Ht7kuuDB023CE0Pke6wopzL7puXZHac7dvnRMfsB6eZ6EXBqeIS2bd9knfEALr1Dj7KuBdltpamnhjUQNLT6rS6HBEla0krtW5wZecIaLHbStlFHjnII1hd5hiVM1GyxpXWs4hw0R9ABLSmhUBWsslF3iYvep_C1QQINTDTYqRV2KVryiiu-nijwsthVJVXTM9ofBOI97f_OIXV2cX59d9gdpMPLvs-QuyB79NEj8nZFmN36QPSTROPalEwUydEPXGQhpWV44COPIikTkekNpGdz8z64fs_DF_g |
| ContentType | Journal Article |
| DBID | DOA |
| DOI | 10.22067/jhs.2021.61722.0 |
| DatabaseName | Directory of Open Access Journals |
| DatabaseTitleList | |
| Database_xml | – sequence: 1 dbid: DOA name: Directory of Open Access Journals url: http://www.doaj.org/ sourceTypes: Open Website |
| DeliveryMethod | fulltext_linktorsrc |
| Discipline | Agriculture |
| EISSN | 2423-3986 |
| EndPage | 505 |
| ExternalDocumentID | oai_doaj_org_article_47ca4b8b87d24559bdbec5c2c89f4510 |
| GroupedDBID | ALMA_UNASSIGNED_HOLDINGS GROUPED_DOAJ M~E RIG |
| ID | FETCH-doaj_primary_oai_doaj_org_article_47ca4b8b87d24559bdbec5c2c89f45103 |
| IEDL.DBID | DOA |
| ISSN | 2008-4730 |
| IngestDate | Tue Oct 22 15:14:52 EDT 2024 |
| IsDoiOpenAccess | true |
| IsOpenAccess | true |
| IsPeerReviewed | true |
| IsScholarly | true |
| Issue | 4 |
| Language | Persian |
| LinkModel | DirectLink |
| MergedId | FETCHMERGED-doaj_primary_oai_doaj_org_article_47ca4b8b87d24559bdbec5c2c89f45103 |
| OpenAccessLink | https://doaj.org/article/47ca4b8b87d24559bdbec5c2c89f4510 |
| ParticipantIDs | doaj_primary_oai_doaj_org_article_47ca4b8b87d24559bdbec5c2c89f4510 |
| PublicationCentury | 2000 |
| PublicationDate | 2022-02-01 |
| PublicationDateYYYYMMDD | 2022-02-01 |
| PublicationDate_xml | – month: 02 year: 2022 text: 2022-02-01 day: 01 |
| PublicationDecade | 2020 |
| PublicationTitle | Majallah-i ʻulūm-i bāghbānī |
| PublicationYear | 2022 |
| Publisher | Ferdowsi University of Mashhad |
| Publisher_xml | – name: Ferdowsi University of Mashhad |
| SSID | ssib041914560 ssib044752250 ssj0002039646 ssib038075762 ssib049002826 |
| Score | 4.448143 |
| Snippet | در ایران، بسیاری از ارقام محلی زردآلو توسط باغداران و نهالکاران با هدف بهره‌برداری از ارقام جدید در میان استانها جابجا شده و متعاقباً در برخی موارد نام... |
| SourceID | doaj |
| SourceType | Open Website |
| StartPage | 493 |
| SubjectTerms | تجزیه خوشه ای مدیریت ژرم پلاسم نشانگر مولکولی هم نامی |
| Title | غربالگری برخی ارقام تجاری زردآلوی ایران با استفاده از نشانگرهای ریزماهواره با هدف شناسایی همنامیها |
| URI | https://doaj.org/article/47ca4b8b87d24559bdbec5c2c89f4510 |
| Volume | 35 |
| hasFullText | 1 |
| inHoldings | 1 |
| isFullTextHit | |
| isPrint | |
| link | http://sdu.summon.serialssolutions.com/2.0.0/link/0/eLvHCXMwrV07T8MwELagEwyIp3grA2tfrvMaC7QqCwsMbFVSJ0gMBRXYKWqaDvkVLEEVImrphPghNt34Jdw5VVUmBphin-8hx47uLrY_E3Jg6g1umCU_61u-AwmKaWRtz3Oy4CqZo7uWX1SXTdTOzNML67iCMDnTq75wT1gKD5y-uDwzGw5zLdcyOWUQ_rocrOoN2rBsn-mTw1UFeyaZgpmEKOoQSE8dN0MUs5lEAFHu6Mx6HrNV7mFM_87QQsk21CkftT-AwXeQLolShDvPXymkb1rMof-nucIPwH_lmarLZGkSUmrltCsrZM53Vsli-bI1gdXw1siHeBcD8Sxi2flMxGAcaVAZiFcsxGIgH6El0ERfvGAVqUNoTsST7MieYhpHQIhlFwVjFHoTfdmGZyJDrA412RUj5EADMkQJDVWJoQyAHMqeshSmCoAhkW1NjEAKdQE38ANX8PUQIU0G4wiLoGidnFQr50e1LHa-fpPCY9QRsFoRYBjrk2Gs_zaMpQ2SaV43vU2ieQXOLbPEDcYhVrN9B3I4T-cQKro6ZIx0ixz-3d72fyjZIQsUT0OoTdy7JHPXuvf2yPwtv99X0_EbR2wg3g |
| link.rule.ids | 315,783,787,867,2109,27936,27937 |
| linkProvider | Directory of Open Access Journals |
| openUrl | ctx_ver=Z39.88-2004&ctx_enc=info%3Aofi%2Fenc%3AUTF-8&rfr_id=info%3Asid%2Fsummon.serialssolutions.com&rft_val_fmt=info%3Aofi%2Ffmt%3Akev%3Amtx%3Ajournal&rft.genre=article&rft.atitle=%D8%BA%D8%B1%D8%A8%D8%A7%D9%84%DA%AF%D8%B1%DB%8C+%D8%A8%D8%B1%D8%AE%DB%8C+%D8%A7%D8%B1%D9%82%D8%A7%D9%85+%D8%AA%D8%AC%D8%A7%D8%B1%DB%8C+%D8%B2%D8%B1%D8%AF%D8%A2%D9%84%D9%88%DB%8C+%D8%A7%DB%8C%D8%B1%D8%A7%D9%86+%D8%A8%D8%A7+%D8%A7%D8%B3%D8%AA%D9%81%D8%A7%D8%AF%D9%87+%D8%A7%D8%B2+%D9%86%D8%B4%D8%A7%D9%86%DA%AF%D8%B1%D9%87%D8%A7%DB%8C+%D8%B1%DB%8C%D8%B2%D9%85%D8%A7%D9%87%D9%88%D8%A7%D8%B1%D9%87+%D8%A8%D8%A7+%D9%87%D8%AF%D9%81+%D8%B4%D9%86%D8%A7%D8%B3%D8%A7%DB%8C%DB%8C+%D9%87%D9%85%E2%80%8C%D9%86%D8%A7%D9%85%DB%8C%E2%80%8C%D9%87%D8%A7&rft.jtitle=Majallah-i+%CA%BBul%C5%ABm-i+b%C4%81ghb%C4%81n%C4%AB&rft.au=%D9%85%D9%87%D8%AF%DB%8C+%D8%B1%D8%B6%D8%A7%D8%A6%DB%8C&rft.au=%D9%85%DB%8C%D8%AA%D8%B1%D8%A7+%D8%B1%D8%AD%D9%85%D8%AA%DB%8C&rft.au=%D8%B9%D8%A8%D8%AF%D8%A7%D9%84%D8%B1%D8%B6%D8%A7+%DA%A9%D8%A7%D9%88%D9%86%D8%AF&rft.au=%D9%85%D8%B1%D8%AA%D8%B6%DB%8C+%D9%87%D9%85%D8%AA%DB%8C&rft.date=2022-02-01&rft.pub=Ferdowsi+University+of+Mashhad&rft.issn=2008-4730&rft.eissn=2423-3986&rft.volume=35&rft.issue=4&rft.spage=493&rft.epage=505&rft_id=info:doi/10.22067%2Fjhs.2021.61722.0&rft.externalDBID=DOA&rft.externalDocID=oai_doaj_org_article_47ca4b8b87d24559bdbec5c2c89f4510 |
| thumbnail_l | http://covers-cdn.summon.serialssolutions.com/index.aspx?isbn=/lc.gif&issn=2008-4730&client=summon |
| thumbnail_m | http://covers-cdn.summon.serialssolutions.com/index.aspx?isbn=/mc.gif&issn=2008-4730&client=summon |
| thumbnail_s | http://covers-cdn.summon.serialssolutions.com/index.aspx?isbn=/sc.gif&issn=2008-4730&client=summon |