Analysis of the stability of housekeeping gene expression in the left cardiac ventricle of rats submitted to chronic intermittent hypoxia

• Published in: Jornal brasileiro de pneumologia Vol. 42; no. 3; pp. 211 - 214
• Main Authors: Julian, Guilherme Silva, Oliveira, Renato Watanabe de, Tufik, Sergio, Chagas, Jair Ribeiro
• Format: Journal Article
• Language: English; Portuguese
• Published: Brazil Sociedade Brasileira de Pneumologia e Tisiologia 01-05-2016
• Subjects: Animals; Brief Communication; Cardiovascular diseases; Cell hypoxia; Disease Models, Animal; Gene Expression; Genes, Essential; Heart Ventricles - physiopathology; Hypoxia - genetics; Hypoxia - physiopathology; Male; Models, animal; Polymerase chain reaction; Rats, Wistar; Real-Time Polymerase Chain Reaction; Reference standards; Reference Values; RESPIRATORY SYSTEM; Sleep apnea, obstructive; Sleep Apnea, Obstructive - genetics; Sleep Apnea, Obstructive - physiopathology; Reference standards; Polymerase chain reaction; Apneia do sono tipo obstrutiva; Models, animal; Doenças cardiovasculares; Modelos animais; Sleep apnea, obstructive; Cell hypoxia; Cardiovascular diseases; Hipóxia celular; Reação em cadeia da polimerase; Padrões de referência
• ISSN: 1806-3713; 1806-3756; 1806-3756; 1806-3713
• DOI: 10.1590/S1806-37562015000000133

Obstructive sleep apnea (OSA) has been associated with oxidative stress and various cardiovascular consequences, such as increased cardiovascular disease risk. Quantitative real-time PCR is frequently employed to assess changes in gene expression in experimental models. In this study, we analyzed the effects of chronic intermittent hypoxia (an experimental model of OSA) on housekeeping gene expression in the left cardiac ventricle of rats. Analyses via four different approaches-use of the geNorm, BestKeeper, and NormFinder algorithms; and 2-ΔCt (threshold cycle) data analysis-produced similar results: all genes were found to be suitable for use, glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase and 18S being classified as the most and the least stable, respectively. The use of more than one housekeeping gene is strongly advised. RESUMO A apneia obstrutiva do sono (AOS) tem sido associada ao estresse oxidativo e a várias consequências cardiovasculares, tais como risco aumentado de doença cardiovascular. A PCR quantitativa em tempo real é frequentemente empregada para avaliar alterações na expressão gênica em modelos experimentais. Neste estudo, analisamos os efeitos da hipóxia intermitente crônica (um modelo experimental de AOS) na expressão de genes de referência no ventrículo cardíaco esquerdo de ratos. Análises a partir de quatro abordagens - uso dos algoritmos geNorm, BestKeeper e NormFinder e análise de dados 2-ΔCt (ciclo limiar) - produziram resultados semelhantes: todos os genes mostraram-se adequados para uso, sendo que gliceraldeído-3-fosfato desidrogenase e 18S foram classificados como o mais e o menos estável, respectivamente. A utilização de mais de um gene de referência é altamente recomendada.