Optimization of heterologous microsatellites in Piracanjuba

The objective of this work was to evaluate 41 microsatellite markers for heterologous amplifications in piracanjuba (Brycon orbignyanus). Some markers were tested for the first time. Loci were optimized for PCR conditions and applied to a sample of 49 individuals. Thirty-one loci resulted in PCR pro...

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Published in:	Pesquisa agropecuaria brasileira Vol. 50; no. 12; pp. 1236 - 1239
Main Authors:	Carmo, Fausto Moreira da Silva, Polo, Érico Macedo, Silva, Marcos Antônio da, Yazbeck, Gabriel de Menezes
Format:	Journal Article
Language:	English
Published:	Embrapa Secretaria de Pesquisa e Desenvolvimento; Pesquisa Agropecuária Brasileira 01-12-2015 Embrapa Informação Tecnológica
Subjects:	AGRICULTURE, DAIRY & ANIMAL SCIENCE AGRICULTURE, MULTIDISCIPLINARY aquacultura Brycon orbignyanus marcadores moleculares procriação hatchery aquaculture marcadores moleculares procriação aquacultura molecular markers Brycon orbignyanus
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Description
Summary:	The objective of this work was to evaluate 41 microsatellite markers for heterologous amplifications in piracanjuba (Brycon orbignyanus). Some markers were tested for the first time. Loci were optimized for PCR conditions and applied to a sample of 49 individuals. Thirty-one loci resulted in PCR product formation, whereas ten loci yielded intelligible polymorphic patterns in the evaluated sample and can be used for amplifications in this species. From the evaluated markers, four loci (BoM1, BoM13, Bh6, and Bh16) are valid to be applied in the study of piracanjuba. Resumo: O objetivo deste trabalho foi avaliar 41 marcadores microssatélites para amplificação heteróloga em piracanjuba (Brycon orbignyanus). Alguns marcadores foram testados pela primeira vez. Os loci foram otimizados para condições de PCR e aplicados a uma amostra de 49 indivíduos. Trinta e um loci resultaram em formação de produtos de PCR, enquanto dez loci resultaram em padrões polimórficos inteligíveis na amostra avaliada e podem ser usados para amplificações nessa espécie. Dos marcadores avaliados, quatro loci (BoM1, BoM13, Bh6 e Bh16) são válidos para aplicação em estudos em piracanjuba.
ISSN:	0100-204X 1678-3921 0100-204X
DOI:	10.1590/S0100-204X2015001200015