Camera trap surveys of A tlantic F orest mammals: A data set for analyses considering imperfect detection (2004–2020)

Abstract Camera traps became the main observational method of a myriad of species over large areas. Data sets from camera traps can be used to describe the patterns and monitor the occupancy, abundance, and richness of wildlife, essential information for conservation in times of rapid climate and la...

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Published in:	Ecology (Durham) Vol. 105; no. 5
Main Authors:	Franceschi, Ingridi Camboim, Dornas, Rubem Augusto da Paixão, Lermen, Isabel Salgueiro, Coelho, Artur Vicente Pfeifer, Vilas Boas, Ademir Henrique, Chiarello, Adriano Garcia, Paglia, Adriano Pereira, de Souza, Agnis Cristiane, Borsekowsky, Alana Rafaela, Rocha, Alessandro, Bager, Alex, de Souza, Alexander Zaidan, Lopes, Alexandre Martins Costa, de Moura, Aloysio Souza, Ferreira, Aluane Silva, García‐Olaechea, Alvaro, Delciellos, Ana Cláudia, Bacellar, Ana Elisa de Faria, Campelo, Ana Kellen Nogueira, Paschoal, Ana Maria Oliveira, Rolim, Anderson Claudino, da Silva, André Luiz Ferreira, Lanna, Andre Monnerat, da Silva, André Pereira, Guimarães, Andresa, Cardoso, Ângela, Cassol, Angelica Soligo, da Costa‐Pinto, Anna Ludmilla, do Nascimento, Ariel Guilherme Santos, Fernandes, Arthur Soares, Clyvia, Aryanne, Santos, Aureo Banhos dos, Lima‐Silva, Barbara, Beisiegel, Beatriz de Mello, Luciano, Beatriz Fernandes Lima, Leopoldo, Bernardo de Faria, Krobel, Bruna Nunes, Kubiak, Bruno Busnello, Saranholi, Bruno Henrique, Correa, Bruno Senna, Sant Anna Teixeira, Caio, Ayroza, Camila Rezende, Cassano, Camila Righetto, Benitez‐Riveros, Camilo, Gestich, Carla Cristina, Tedesco, Carla Denise, Gheler‐Costa, Carla, Hegel, Carla Grasiele Zanin, Evangelista Junior, Carlito da Silva, Ferreira, Carlos Eduardo Morando Faria, Grelle, Carlos Eduardo Viveiros, Esteves, Carolina Franco, Espinosa, Caroline da Costa, Leuchtenberger, Caroline, Sanchéz‐Lalinde, Catalina, Machado, Cauanne Iglesias Campos, Andreazzi, Cecilia, Bueno, Cecília, Cronemberger de Faria, Cecilia, Novaes, Claudio, Widmer, Cynthia Elisa, Santos, Cyntia Cavalcante, Ferraz, Daniel da Silva, Galiano, Daniel, Bôlla, Daniela Aparecida Savariz, Behs, Daniela, Rodrigues, Daniele Pereira, de Melo, Danielle Picão, Ramos, Déborah Maria Soares, de Mattia, Denise Lidório, Pavei, Diego Dias, Loretto, Diogo, Huning, Douglas da Silva, Dias, Douglas de Matos, Paetzhold, Éder Ricardo, Rios, Elaine, Setz, Eleonore Zulnara Freire, Cazetta, Eliana, Cafofo Silva, Emanuel Giovani, Pasa, Emanuelle, Saito, Erica Naomi, de Aguiar, Erick Francisco Silva, Castro, Érika Paula, Viveiros de Castro, Ernesto Bastos, Pedó, Ezequiel, Pereira, Fabiane de Aguiar, Bolzan, Fábio, Roque, Fábio de Oliveira, Mazim, Fábio Dias, Comin, Fábio Henrique, Maffei, Fábio, Peters, Felipe Bortolotto, Fantacini, Felipe Moreli, da Silva, Felipe Pessoa, Machado, Felipe Santana, Vélez‐Garcia, Felipe, Lage, Fernanda Stussi Duarte, Perini, Fernando Araújo, Passos, Fernando Camargo, Carvalho, Fernando
Format:	Journal Article
Language:	English
Published:	01-05-2024
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Summary:	Abstract Camera traps became the main observational method of a myriad of species over large areas. Data sets from camera traps can be used to describe the patterns and monitor the occupancy, abundance, and richness of wildlife, essential information for conservation in times of rapid climate and land‐cover changes. Habitat loss and poaching are responsible for historical population losses of mammals in the Atlantic Forest biodiversity hotspot, especially for medium to large‐sized species. Here we present a data set from camera trap surveys of medium to large‐sized native mammals (>1 kg) across the Atlantic Forest. We compiled data from 5380 ground‐level camera trap deployments in 3046 locations, from 2004 to 2020, resulting in 43,068 records of 58 species. These data add to existing data sets of mammals in the Atlantic Forest by including dates of camera operation needed for analyses dealing with imperfect detection. We also included, when available, information on important predictors of detection, namely the camera brand and model, use of bait, and obstruction of camera viewshed that can be measured from example pictures at each camera location. Besides its application in studies on the patterns and mechanisms behind occupancy, relative abundance, richness, and detection, the data set presented here can be used to study species' daily activity patterns, activity levels, and spatiotemporal interactions between species. Moreover, data can be used combined with other data sources in the multiple and expanding uses of integrated population modeling. An R script is available to view summaries of the data set. We expect that this data set will be used to advance the knowledge of mammal assemblages and to inform evidence‐based solutions for the conservation of the Atlantic Forest. The data are not copyright restricted; please cite this paper when using the data. Resumo As armadilhas fotográficas tornaram‐se o principal método de observação de muitas espécies em grandes áreas. Os dados obtidos com armadilhas fotográficas podem ser usados para descrever os padrões e monitorar a ocupação, abundância e riqueza da vida selvagem, informação essencial para a conservação em tempos de rápidas mudanças climáticas e de cobertura do solo. A perda de habitat e a caça furtiva são responsáveis pelas perdas populacionais históricas de mamíferos no hotspot de biodiversidade da Mata Atlântica, especialmente para espécies de médio e grande porte. Aqui apresentamos um conjunto de dados de levantamentos com armadilhas fotográficas de mamíferos de médio e grande porte (>1 kg) em toda a Mata Atlântica. Compilamos dados de 5.380 armadilhas fotográficas instaladas no nível do chão em 3.046 locais, de 2004 a 2020, resultando em 43.068 registros de 58 espécies. Esses dados acrescentam aos conjuntos de dados existentes de mamíferos na Mata Atlântica por incluir as datas de operação das câmeras, que são necessárias para análises que lidam com detecção imperfeita. Também incluímos, quando disponíveis, informações sobre importantes preditores de detecção, como marca e modelo da câmera, uso de isca e obstrução do visor da câmera que pode ser medido a partir de imagens de exemplo em cada local da câmera. Além de estudos sobre os padrões e mecanismos por trás da ocupação, abundância relativa, riqueza e detecção, o conjunto de dados aqui apresentado pode ser usado para estudar os padrões de atividade diária das espécies, nível de atividade e interações espaço‐temporais entre as espécies. Além disso, os dados podem ser usados em combinação com outras fontes de dados em diversas análises com modelagem populacional integrada. Um script R está disponível para visualizar um resumo do conjunto de dados. Esperamos que este conjunto de dados seja usado para aumentar o conhecimento sobre as assembleias de mamíferos e usado para informar soluções baseadas em evidências para a conservação da Mata Atlântica. Os dados não são restritos por direitos autorais e, por favor, cite este documento ao usar os dados.
ISSN:	0012-9658 1939-9170
DOI:	10.1002/ecy.4298