甜瓜14—3—3基因家族全基因组鉴定与进化分析
以拟南芥的14—3—3蛋白保守结构域为探针序列，对甜瓜全基因组的蛋白质数据库进行搜索，获得9个14—3—3蛋白序列，其中ε类5个、非ε类4个。对甜瓜14—3—3基因家族进行了系统发生分析、内含子数量分析、序列相似性比对，通过对所有甜瓜的14—3—3蛋白相匹配的Unigene分析后发现，部分基因在多种组织中均有表达，部分基因在甜瓜果实以及花中高丰度特异表达，而且不同成员之间的表达模式存在较大差异。甜瓜14—3—3基因家族成员的分子进化及表达模式的研究结果表明基因重复后发生功能分化。...
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| Published in: | 广东农业科学 Vol. 40; no. 24; pp. 104 - 111 |
|---|---|
| Main Author: | |
| Format: | Journal Article |
| Language: | Chinese |
| Published: |
包头师范学院生物科学与技术学院,内蒙古包头014030%内蒙古大学生命科学学院/内蒙古自治区牧草与特色作物生物技术重点实验室,内蒙古呼和浩特,010021
2013
内蒙古大学生命科学学院/内蒙古自治区牧草与特色作物生物技术重点实验室,内蒙古呼和浩特010021 |
| Subjects: | |
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| Summary: | 以拟南芥的14—3—3蛋白保守结构域为探针序列，对甜瓜全基因组的蛋白质数据库进行搜索，获得9个14—3—3蛋白序列，其中ε类5个、非ε类4个。对甜瓜14—3—3基因家族进行了系统发生分析、内含子数量分析、序列相似性比对，通过对所有甜瓜的14—3—3蛋白相匹配的Unigene分析后发现，部分基因在多种组织中均有表达，部分基因在甜瓜果实以及花中高丰度特异表达，而且不同成员之间的表达模式存在较大差异。甜瓜14—3—3基因家族成员的分子进化及表达模式的研究结果表明基因重复后发生功能分化。 |
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| Bibliography: | 44-1267/S melon; 14-3-3 protein; gene family; phylogenetic analysis MA Yong, LIU Jia-rong, BADE Ren-gui, HASI Agu-la （1. College of Life Scienees, Inner Mongolia University/Inner Mongolia Key Laboratory of Herbage＆Endemic Crop Biotechnology, Hohhot 010021, China; 2.Department of Biological Science and Technology, Baotou Teacher＇s College, Baotou 014030, China） Nine 14-3-3 genes including five e-type 14-3-3 gene, and four non-e-type 14-3-3 family gene, were identified from the melon genome protein database which was based on conserved domains of 14-3-3 proteins as probe sequences in Arabidopsis. Phylogenetic analysis, numbers of intron analysis, alignment of sequence similarity was performed in 14-3-3 gene family in melon. The results of analysis of Unigenes matched with 14-3-3 proteins showed that 14-3-3 genes expressed in different tissues, part of genes specifically expressed with high abundance in fruit and flower, and different members of 14-3-3 gene family exhibited difference in patterns of expression. In |
| ISSN: | 1004-874X |