基于SNP和InDel标记的巴西木薯遗传多样性与群体遗传结构分析

为了对巴西木薯种质资源进行遗传多样性、亲缘关系和群体遗传结构分析,本研究利用了7946个SNPs和1997个InDels分子标记,通过ADMIXTURE软件进行群体结构分析、GCTA软件进行主成分分析.结果显示,巴西木薯被划分为9个亚群.这与利用PHYLIP进行的聚类分析结果大概一致,其中亚群1、亚群2、亚群4、亚群6和亚群8能较好地分别聚在一起,而其他亚群中的样品大致能聚在一起,且样品间有一定的交叉.巴西木薯种质资源遗传多样性指数(0.274)高于中国、尼日利亚等,其中巴西木薯亚群5具有相对较高的遗传多样性水平(0.29).巴西木薯各亚群的群体遗传分化程度较低(群体分化指数在0.03～0.1...

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Published in:	作物学报 Vol. 47; no. 1; pp. 42 - 49
Main Authors:	孙倩, 邹枚伶, 张辰笈, 江思容, Eder Jorge de Oliveira, 张圣奎, 夏志强, 王文泉, 李有志
Format:	Journal Article
Language:	Chinese
Published:	广西大学生命科学与技术学院 / 亚热带农业生物资源保护与利用国家重点实验室, 广西南宁 530004 12-01-2021 海南大学, 海南海口 570203%中国热带农业科学院热带生物技术研究所, 海南海口 571101 海南大学, 海南海口 570203 南京农业大学, 江苏南京 210095%广西大学生命科学与技术学院 / 亚热带农业生物资源保护与利用国家重点实验室, 广西南宁 530004 南京农业大学, 江苏南京 210095%Embrapa Mandioca e Fruticultura, Cruz das Almas, Bahia 44380-000, Brazil%齐鲁工业大学, 山东济南 250306%中国热带农业科学院热带生物技术研究所, 海南海口 571101 中国热带农业科学院热带生物组学大数据中心, 海南海口 571101 中国热带农业科学院热带生物技术研究所, 海南海口 571101%中国热带农业科学院热带生物技术研究所, 海南海口 571101%中国热带农业科学院热带生物技术研究所, 海南海口 571101
Subjects:	InDel 木薯 SNP 遗传多样性 群体结构
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